DZ是一种广谱杀菌剂，其作用机制是与真菌细胞中存在的亲核位点(如氨基、羟基和巯基)发生羰基化反应来控制土壤传播的真菌病原体 [4] 。

用DZ作为熏蒸剂熏蒸土壤，土壤细菌多样性改变情况略有不同，要么增加 [5] ，要么减少 [6] ，要么没有显著影响 [7] 。这种对土壤细菌多样性造成效果不同的原因可能是因为不同试验设计中DZ剂量使用有所不同；或者是因为土壤理化性质和环境条件有所差异，这些不同的使用条件影响了其作为一种杀菌剂的发挥效果 [8] [9] 。例如，在湿度较高的情况下DZ可以更快地分解成高效杀菌剂异硫氰酸甲酯(MITC) [10] 。当然，就目前为止，细菌的多样性和丰度的变化情况与在使用DZ熏蒸后的对土壤取样时间和取样方法的不同之间的联系尚未清楚。一般来说，目前主流取样方法是在熏蒸处理结束后立即取样，在这一时间段内，因为熏蒸剂的广谱杀菌特性，细菌多样性会显著减少。之后，随着时间的推移，再次取样所观察到的细菌多样性普遍会呈现一种上升的趋势，这可能是因为熏蒸剂效果过后，土壤微生物进行恢复导致多样性上升。根据不同的研究，DZ熏蒸处理过后的土壤细菌多样性会在30~120天内恢复到与空白对照相似的水平 [6] 。以上这些结果表明细菌群落对DZ熏蒸过后表现出较高的恢复力，因为它们能够在DZ熏蒸的土壤中重新定植 [11] 。

CP又称氯化苦，是一种广谱杀菌剂，目前大部分试验表明在120天内，经过CP熏蒸的土壤中，土壤细菌群落的多样性和丰度会出现显著降低的情况 [9] 。这种多样性和丰度的下降可能是由于土壤微生物死亡率增加而导致的，熏蒸后与微生物碳水化合物/脂质运输和代谢相关的蛋白质相对丰度增加，这是微生物死亡率和细胞裂解增加的共同特征 [12] 。在研究中发现，经过CP熏蒸后，与微生物碳水化合物/脂质转运和代谢相关的蛋白质相对丰度增加，这是微生物死亡率和细胞裂解增加的共同特征 [12] 。然而，CP对某些特定细菌属的影响例如，葡萄球菌、Actinomadura、Acinetobacter和链霉菌等有益菌属的相对丰度降低，鞘氨醇单胞菌、假单胞菌数量增加 [13] ，这些菌属的改变有可能对土壤C循环产生影响。其中数量增加的菌属可能对CP熏蒸的耐受性更好，可能具有利用CP作为C源的能力 [14] 。

1,3-d是一种常用用于防治线虫、土传病原体和杂草的土壤熏蒸剂 [15] 。

有研究发现，在1,3-d处理后的前10~25天内，土壤细菌丰度会出现上升的情况，这可能因为被1,3-d熏蒸后线虫死亡，土壤可利用养分的增加或使用1,3-d可作为C源导致的 [16] 。1,3-d熏蒸后细菌群落组成也会发生变化。例如，与对照土壤相比，施用熏蒸剂后28至168天，放线菌、溶菌、假单胞菌、Mycobacterium的相对丰度逐渐增加 [17] 。与此同时，芽孢杆菌、鞘氨醇单胞菌的相对丰度呈下降趋势。出现这种情况的原因可能是因为这些物种对1,3-d熏蒸的耐受性有所差异。例如，假单胞菌可以降解1,3-d。Mocali等人从1,3-d处理超过20年的土壤中分离出的革兰氏阳性细菌数量明显多于革兰氏阴性细菌。这些结果表明，革兰氏阳性细菌比革兰氏阴性细菌更能抵抗熏蒸造成的影响，这可能是由于它们的孢子形成能力和细胞壁组成。

生物熏蒸(Biofumigation)主要是通过利用某些植物组织分解过程中产生的具有消杀或抑制作用的活性物质来抑制或杀死土壤中的有害生物的一种方法 [18] 。Angus等首次发现在小麦田中施加芸薹属植物组织，可以减少土壤中小麦全蚀病菌的数量，并首次将该种土壤处理方法称为生物熏蒸。国外对利用芸薹属植物作为生物熏蒸材料的研究较多，目前已知的生物熏蒸材料甘蓝、芥菜和花椰菜等植物，通过该种土壤熏蒸方式，发现生物熏蒸对镰刀菌、立枯丝核菌、丽花轮枝孢、根腐丝囊霉、疫霉和线虫等多种土传植物病原菌都有一定的抑制作用 [19] 。具研究发现，十字花科芸薹属植物之所以具备对病虫害的消杀特性，主要源于其含有丰富的硫代葡萄糖苷(Glueosinolates, GLs.)，虽然该物质的本身并没有对植物病原菌展现出很强杀生活性，但是一旦植物组织被破坏后，液泡中的黑芥子酶(Myrosinase)释放出来水解硫代葡萄糖苷，会产生大量的异硫酸氰酯(Isothiocyanates, ITC.)类物质，这类物质具有广泛的除草、杀菌等效应，而这也是目前生物熏蒸主要运用来减少有害病原生物的数量的原因。李淑敏等利用芥菜、雪里红和油菜3种芸薹属蔬菜作为生物熏蒸材料对茄子的连作土壤进行熏养处理，结果表明经过生物熏蒸处理后的连作土壤的茄子黄萎病的发病率明显下降 [20] 。巩彪等研究明，土壤中添加大蒜秸秆可以有效的克制番茄根结线虫病，根际土壤中细菌、真菌和放线菌的数量显著增加 [21] 。除此因为，因为生物熏蒸大部分都是通过利用植物组织进行处理土壤，这变相的向土壤中添加了额外的有机质，可以增添土壤养分，减少化学肥料的使用，这也是生物熏蒸的一大优势之一。

通过在作物种植前使用不同的生物熏蒸材料进行熏蒸，可以不同程度的缓解因为土壤连作障碍所引起的各种植物病害，例如在烟草上进行的生物熏蒸材料筛选得出通过使用西兰花和芝麻菜作为熏蒸材料，可以很好的缓解烟草青枯病的发病情况，西兰花和芝麻菜二者对青枯病菌的抑制效果可达95.3%、95.1%。在生物熏蒸中，土壤微生物的组成和变化一直是当前所关注的重点，在使用西兰花处理与芝麻菜处理后，提高了土壤细菌丰度，两组处理下物种多样性均大于对照组 [22] 。变形菌门是细菌中最大的门，其中的许多类群可以进行固氮作用，并能够适应各种复杂的环境，厚壁菌门通常被分类为富营养菌或r-策略细菌，即在富含C或N的条件下能快速生长的微生物，说明生物熏蒸给土壤微生物提供了丰富的碳源或氮源从而促进了厚壁菌门细菌的生长，这可能是因为生物熏蒸所添加的植物组织本身可以作为一种有机质的补充，增添土壤营养 [22] 。通过芥菜(Brassica napiformis, BFN)和油菜(Brassica napus, BFC)做为熏蒸材料处理大丽黄萎病，在茄子移栽15 d后，经过熏蒸的土壤真菌、细菌的多样性出现显著下降。在移栽后15天，各处理茄子样品的有益土壤细菌为黄杆菌、节杆菌、芽孢杆菌和假单胞菌。但是经过芥菜熏蒸处理的黄杆菌和假单胞菌丰度是对照处理的10倍。假单胞菌、黄杆菌和摩氏菌的相对群落丰度显著高于其他处理。已知细菌中的黄杆菌属、节杆菌属和芽孢杆菌属以及真菌中的毛菌属和摩氏菌属中都含有能够对出病原体表现出一定拮抗作用的菌株，这可能是芥菜和油菜熏蒸后茄子的黄萎病发病减轻的原因之一。Hollister等人(2013)使用芥菜(含有固定油脂和GSLs的种子)、亚麻(含有固定油脂但不含GSLs的种子)和高粱(不含GSLs)作为对照，验证了生物熏蒸的效果，得出了类似的结果。他们的研究结果表明，芥菜诱导与真菌疾病抑制相关的细菌分类群(如芽孢杆菌、假单胞菌和链霉菌)的丰度大幅增加，从而对植物病害起到一定程度的抑制作用。对于非土传病害，生物熏蒸依旧能起到很好的防治功效，例如对采后的苹果进行芥菜的熏蒸，可以很好的防治苹果灰霉病的发生，经过芥菜熏蒸后，观察到一些显著的异常现象。如灰霉病菌菌丝体出现扭曲肿胀，分枝增加，尖端发育不良的情况，与此同时还发现芥菜熏蒸后灰霉病菌孢子的产生也能得到很好的抑制，除此以外，芥菜熏蒸的抑菌图谱具有广泛性，对于荔枝疫霉(Phytophthora litchii)、蛇皮霉(Pythium aphanidermatum)、尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum)、番茄镰刀菌(Fusarium solani)、炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides)也具有抑制作用 [23] ，这可能是因为芥菜中硫代葡萄糖苷物质，该物质水解产生的异硫氰酸酯在有实验中表明对番茄灰霉病的EC50最低 [24] ，这可能也是其对其他诸多真菌病害有影响的原因之一。

对于地下害虫的防治，生物熏蒸同样具有很好的效果，如通过花椒种子熏蒸可以控制番茄根结线虫，经过花椒种子熏蒸后番茄根结线虫发病率出现了明显的降低，这可能与花椒种子所含的一些挥发性物质包括桉树醇(桉树脑)、β-茶香烯、辛酸(癸酸)、己酸(癸酸)和黄原酸有关，这些物质在以往试验中表现出一定的杀虫和杀菌的活性 [25] ，可以对害虫产生接触毒害、抑制害虫生育能力来抑制害虫 [26] 。辛酸和己酸具有杀线虫活性。番木瓜种子熏蒸可以控制番茄根结线虫，通过分析木瓜种子的挥发性物质，并对其挥发性物质做出纯化后分别用于根结线虫的防治，最后得出乙酸乙烯酯、苯乙醛和苯乙腈这几种木瓜种子挥发物中含有对根结线虫具有毒性的物质 [27] 。

生物熏蒸在缓解连作障碍方面研究较少，王晓芳等利用利用万寿菊粉末在种植25年苹果土壤中进行熏蒸，增加了土壤有益细菌的数量，降低了土壤中病原真菌数量，维持了土壤微生物群落结构的多样性，缓解连作障碍 [28] 。在连作10年的桃园，以茭白秸秆为原材料进行土壤熏蒸，显著提高了土壤脲酶、蔗糖酶、酸性磷酸酶和过氧化氢酶活性，增加了镰孢菌属、青霉属(Penicillium)、毛壳菌属(Chaetomium)等有益菌类的相对丰度，降低了真菌、细菌的多样性和细菌丰富度、真菌均匀度，提高土壤养分，缓解桃树连作障碍 [29] 。

在连作土壤中芸薹属蔬菜作为绿肥改善了土壤理化性质。利用二道眉芥菜作熏蒸材料，连作12年茄子大棚土壤有机质含量比不使用熏蒸剂处理增加1.61倍，病原菌大丽轮枝菌数量比不使用熏蒸剂处理降低34.74%，缓解大棚茄子的连作障碍 [20] 。使用高硫芥菜对连作3年的黄瓜土壤进行熏蒸，土壤有机质含量在黄瓜苗期、花期、盛果期和拉秧期分别比不进行熏蒸处理的土壤增加48.42%、23.11%、17.36%和12.83%，并且熏蒸后显著提高土壤速效钾含量，更有利于维持地力 [30] 。