bp Bioprocess 2164-5566 2164-5582 beplay体育官网网页版等您来挑战! 10.12677/bp.2025.151005 bp-109008 Articles 生命科学 水稻根际解磷菌的筛选鉴定与促生功能研究
Screening, Identification of Phosphate-Solubilizing Bacteria in Rice Rhizosphere and Their Plant Growth-Promoting Functions
浙江师范大学生命科学学院,浙江 金华 24 02 2025 15 01 29 38 23 1 :2025 1 1 :2025 1 3 :2025 Copyright © 2024 beplay安卓登录 All rights reserved. 2024 This work is licensed under the Creative Commons Attribution International License (CC BY). http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ 目的:磷是作物生长发育不可或缺的关键营养元素。在土壤中,大多数磷素都以难溶性磷酸盐状态存在,难以被植物直接吸收利用。土壤中含有大量的解磷菌,筛选高效的解磷菌可促进磷转化,改善土壤质量,促进植物生长。方法:利用梯度稀释法对微生物进行分离,并对其进行纯化与鉴定。评价菌株的生长特性、解磷能力。结果:从水稻根际土中共筛选到三株高效解磷菌,分别是神户肠杆菌(Enterobacter kobei) C3、恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida) P6和铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa) P12。相比商业常用高效解磷菌荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens) PF,铜绿假单胞菌P12具有更强的解无机磷(磷酸钙)的能力,而神户肠杆菌C3解有机磷(植酸钙(Ca-Phyt))能力更强。最后,四株解磷菌组合成的混合菌群能够更好地促进水稻生长并提高水稻对磷的吸收。结论:为微生物菌剂的研制和应用提供了理论基础。
Objective: Phosphorus is a crucial nutrient element for crop growth and development. In soil, the majority of phosphorus exists in the form of insoluble phosphates, making it inaccessible for direct absorption and utilization by plants. The soil harbors a vast number of phosphate-solubilizing bacteria. Screening highly efficient phosphate-solubilizing bacteria can promote the transformation of phosphorus, improve soil quality, and facilitate plant growth. Methods: Separate microorganisms using the gradient dilution method, and purify and identify them. Evaluate the growth characteristics and phosphate-solubilizing ability of the strains. Results: A total of three highly efficient phosphate-solubilizing bacteria were screened from the rhizosphere soil of rice, namely Enterobacter kobei C3, Pseudomonas putida P6, and Pseudomonas aeruginosa P12. Compared with Pseudomonas fluorescens PF, a commonly used commercial high-efficiency phosphate-solubilizing bacterium, P12 has a stronger ability to solubilize inorganic phosphorus (calcium phosphate), while C3 exhibits a stronger ability to solubilize organic phosphorus (calcium phytate (Ca-Phyt)). Finally, the mixed flora composed of the four phosphate-solubilizing bacteria can promote the growth of rice and enhance the phosphorus absorption of rice. Conclusion: This provides a theoretical basis for the development and application of microbial inoculants.
解磷菌,筛选鉴定,解磷能力,促生
Phosphate-Solubilizing Bacteria
Screening and Identification Phosphate-Solubilizing Ability Plant Growth Promotion
1. 引言

磷对于作物的生长发育进程而言,属于不可或缺的关键营养要素。在农业生产过程中,磷元素参与植物的生长、发育、细胞分裂、光合作用等多种过程,并存在于各种酶中,参与其活性和功能的调节过程 [1] 。在土壤中,磷素主要呈现出两种形式,即无机磷与有机磷 [2] 。就无机磷而言,仅有一小部分呈可溶性磷酸盐形态,也就是( H 2 PO 4 / HPO 4 2 ),能够直接被植物吸收利用。而大部分无机磷极易与Ca2+、Fe2+、Al3+这类金属阳离子发生络合反应,进而化合生成磷酸铁(FePO4)、磷酸铝(AlPO4)以及磷酸钙(Ca3(PO4)2)等磷酸盐物质,被牢牢固定在土壤之中,难以被植物直接摄取利用。在土壤所含的有机磷成分里,植酸占据了较大比重,植物根系无法直接从中获取磷元素 [3] 。通常需要被水解酶——植酸酶催化水解成正磷酸盐,才可被植物吸收利用 [4] 。为保障作物高产,大量磷肥被施加到田间,但其不仅容易被固定为难溶无机磷与有机磷,导致磷肥利用率低,且易流失造成水体富营养化等环境污染 [5]

土壤中的解磷微生物能将难溶磷转化为可被植物直接吸收利用的磷。解磷菌(phosphate-solubilizing bacteria, PSB)主要是通过酸解和酶解来发挥作用的 [6] [7] 。对于不溶性的无机磷,PSB通过分泌低分子量有机酸转化为可溶性磷,也可以通过释放H+,从而降低土壤的pH值 [8] 。对于不溶性的有机磷,PSB通过分泌酶催化有机磷矿化,在这些酶当中,磷酸酶与植酸酶较为常见。张朝楠等在盐碱土中筛到了一株耐盐解磷菌(CZ-B1)——解淀粉芽孢杆菌,这种菌株的筛选与驯化,可以为在盐碱土壤中生长的植物生长提供P元素 [9] 。俞海阳等在土壤中筛到了一株假单胞菌——JP233,JP233通过溶解有机酸2-葡萄糖酮酸释放有效磷,将JP233接种在玉米植物土壤中,显著增加了玉米地上部和全株的生物量 [10] 。白凯宏等筛选到的假单胞菌属NK2具有溶解不溶性磷Ca3(PO4)2的能力,通过释放有机酸来溶解磷酸盐,例如:草酸、乙酸、葡萄糖酸和柠檬酸,并能提高番茄的生长 [11]

本研究从水稻土中经分离、纯化最终成功筛选出三株解磷能力超群的菌株,分别命名为:C3、P6、P12,经鉴定发现三种菌株分别为神户肠杆菌(Enterobacter kobei)、恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida)、铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)。并和商业常用高效解磷菌荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens) PF作对比。研究旨在为微生物菌肥的开发提供有力支撑。

2. 材料与方法 2.1. 土壤的取样

土壤样品采自杭州大兴水稻田,待水稻收割完毕后,采用“棋盘式布点法”取样,先小心拨开水稻秸秆周边的杂草,然后用小铲子轻轻去除表层1~2 cm的浮土杂质。再用土钻垂直插入土壤,采集10~15 cm深度的土壤样本,每个采样点采集约200 g土壤,将各个采样点的土壤样品充分搅拌,形成混合样本。将样品装在灭菌袋后运回实验室,挑拣出混在其中的残根、碎石等,之后过2 mm规格的筛网。最后把土壤样品置于−80℃的冰箱中保存,以供后续研究利用。

2.2. 供试培养基

LB培养基、NBRIP培养基、植酸钙培养基。

2.3. 解磷菌的分离、筛选

运用梯度稀释法分离解磷菌。称取2.5 g土壤样本,置入盛有50 ml无菌蒸馏水的三角瓶,于28℃、180 r/min的摇床持续震荡30 min,振荡结束后提取上清液,并依照101至1010的梯度逐步进行稀释。吸取50 μl处于不同浓度的上清液,均匀地涂布于NBRIP固体培养基表面,28℃恒温培养3 d。挑取出周边带有溶磷圈的菌落,于LB平板反复划线纯化。挑取单克隆,接种至LB液体培养基内,再次置于28℃的摇床中,持续培养8 h后利用甘油保存菌种,以供后续使用。

2.4. 菌株16S rDNA序列分析及比对

选用细菌16S rDNA通用引物27F:(5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′),1492R:(5′-GGTTACCTTGTTACGACTT-3′)建立PCR扩增体系进行扩增。将PCR产物纯化,测定菌株的基因序列信息,而后借助NCBI数据库所配备的工具BLAST,将菌株的基因序列与GenBank数据库中的序列进行比较,选取同源性性较高的模式菌株序列,以Neighbor Joining法分别构建C3、P6、P12的系统发育树。

2.5. 解磷菌抗性测定

将四株目标菌株各自接种至LB液体培养基内,28℃、220 r/min培养8 h后取出,利用无菌水洗去菌株表面附着的培养基成分,调OD600 = 0.2。按照0.2%的比例分别接种在LB液体培养基中,并设置一定的胁迫。其中,盐浓度分别为:1%、3%、5%、7%、9%。pH分别为:4、6、8、9、10。温度分别为:28℃、15℃。以空LB液体培养基为对照。每隔2 h吸取0.2 ml菌液至酶标板,随后用酶标仪测量菌液OD600的值,并绘制生长曲线。每个处理设置4个重复。

2.6. 低温下菌株可溶磷含量的测定

先将四株菌株分别接种于LB液体培养基,28℃、220 r/min培养8 h取出,用无菌水洗去培养基,调OD600 = 0.6,按2%比例分别接种在NBRIP和植酸钙培养基中,并设置一定的胁迫。其中,温度分别为:28℃、15℃。盐浓度梯度分别为:1%、5%、9%。pH梯度设置为:6、9。以不同温度、盐浓度、不同pH、不加菌的NBRIP和植酸钙培养基分别为空白对照。培养4 d后,用钼锑抗比色法测定菌株的解磷能力。每组处理设置四个重复。

2.7. 菌株促生能力的测定

以野生型粳稻石狩白毛(SSBM)为材料,把培养了7天的SSBM幼苗移至土壤中,四种菌株等比例混合,按照1:1000的比例加混合菌群,以不加菌的土培SSBM为对照。两周后再次加入混合菌群,室外培养30天后,测量生理指标和全磷含量。每组处理做7个重复。

2.8. 数据分析

采用Excel软件进行数据处理,用PPT、GraphPad Prism 9软件进行统计分析和作图,显著性水平P < 0.05。运用MEGA软件构建系统发育树。

3. 结果与分析 3.1. 菌株筛选分离

采用磷酸钙(NBRIP)平板培养基筛选后获得三株解磷菌,分别是神户肠杆菌C3、恶臭假单胞菌P6、铜绿假单胞菌P12。菌株经过纯化以后,在NBRIP、Ca-Phyt平板培养基上培养,有明显透明圈出现。如 图1 所示。从左往右依次是:荧光假单胞菌PF、神户肠杆菌C3、恶臭假单胞菌P6、铜绿假单胞菌P12。

(A):无机磷NBRIP固体培养基;(B):有机磷植酸钙固体培养基;图注:标尺是1 cm。--Figure 1. Phosphorus dissolution circle of four strains on different media--
3.2. 菌株分子生物学鉴定

利用通用引物27F和1492R对三种解磷菌的基因组进行16S序列扩增,经过BLAST比对,如 图2 所示,结果显示:C3与神户肠杆菌(Enterobacter kobei)的相似度较高。P6与恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida)的相似性比较高,P12与铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)完全一致。

3.3. 生长曲线的测定

图3 所示,与28℃下的生长曲线相比,低温环境下四种菌株均可以生长,但进入对数期的速度变慢。另外,温度下降,明显抑制了铜绿假单胞菌P12进入对数期的时间。

高盐不仅会影响微生物体内酶的活性,还会使微生物细胞外的渗透压发生变化。如 图4 ,结果表明,随着盐浓度的升高,四种菌株的生长都受到抑制,进入对数期的时间都延长。相比其他三种菌株,神户肠杆菌神户肠杆菌C3在盐浓度为1%、3%、5%、7%时,较快地进入对数期。在盐浓度为9%时,只有神户肠杆菌C3可以生长。这表明神户肠杆菌C3耐盐能力比较强。

Figure 2. Based on the 16S rRNA gene sequences, a phylogenetic tree was constructed to elucidate the phylogenetic relationships among three strains and their closely related strains--图2. 基于16S rRNA基因序列构建三种菌株及亲缘关系相邻菌株的系统发育树-- Figure 3. Effects of different temperature conditions on the growth of four strains--图3. 不同温度条件对四种菌株生长的影响-- Figure 4. Effects of different salt concentrations on the growth of four strains--图4. 不同盐浓度对四种菌株生长的影响--

酸碱胁迫会影响微生物的生长速率。如 图5 ,在pH = 4的时候,只有神户肠杆菌C3才能生长。在pH = 6、8、9的时候,神户肠杆菌C3进入对数期的时间最快,且在平台期时具有最大的菌含量,这表明神户肠杆菌C3耐酸碱的能力都比较强。在pH = 10的时候,四种菌株都不能生长。

Figure 5. Effects of different acid-base conditions on the growth of four strains--图5. 不同酸碱条件对四种菌株生长的影响--
3.4. 胁迫条件下微生物的解磷能力

通过测定低温环境下菌株的解磷能力,可以判断筛选到的解磷菌在低温胁迫下是否可以解磷。如 图6(A) 所示,在无机磷NBRIP培养基中,低温抑制了神户肠杆菌C3、铜绿假单胞菌P12的解磷能力。但是荧光假单胞菌PF、恶臭假单胞菌P6在低温条件下,解无机磷的能力增强。如 图6(B) 所示,在植酸钙培养基中,在28℃条件下,恶臭假单胞菌P6和铜绿假单胞菌P12解植酸钙的能力很弱,恶臭假单胞菌P6完全没有,铜绿假单胞菌P12略微有一点。荧光假单胞菌PF解植酸钙的能力在低温条件下没有被降低。

注:不同字母(a、b、c、d、e)表示各处理组之间存在显著性差异(P < 0.05)。--Figure 6. Effect of temperature on phosphorus soluble content of four strains--

图7 ,在无机磷培养基中,随着盐浓度的升高,四种菌株解无机磷的能力都降低。其中,在盐浓度为5%和7%时,相比其他三种菌株,神户肠杆菌C3具有最高的解无机磷能力。在植酸钙培养基中,在盐浓度为5%和7%时,CK的溶磷量分别为260 mg/L、266 mg/L,荧光假单胞菌PF、神户肠杆菌C3与不加菌的CK相比,磷含量降低,推测被PSB溶解的有机磷用于细菌自身生长。

图注:横坐标的CK代表不加盐的培养基,右侧的CK代表不加菌的空培养基。不同字母(a、b、c)表示各处理组之间存在显著性差异(P < 0.05)。--

Figure 7. Effect of salt concentration on phosphorus soluble content of four strains

图7. 盐浓度对四种菌株溶磷量的影响

图8 ,在无机磷NBRIP培养基中,当pH = 6时,神户肠杆菌C3的解磷能力最低,铜绿假单胞菌P12的解磷能力最强。在pH = 9时,同样如此。在有机磷植酸钙培养基中,pH = 6、9时,CK的溶磷量分别为369 mg/L、120 mg/L,荧光假单胞菌PF、神户肠杆菌C3与不加菌的CK相比,溶磷含量增加。

图注:横坐标上的CK表示不调pH的培养基,右侧的CK表示不加菌的空培养基。不同字母(a、b、c、d)表示各处理组之间存在显著性差异(P < 0.05)。--

Figure 8. Effect of different pH on phosphorus soluble content of four strains

图8. 不同pH对四种菌株溶磷量的影响

3.5. 菌株的促生能力

图9(A) 所示,施加混合菌后水稻生长明显变好。如 图9(B) ,地上部和根部干重、全磷含量都增加,推测加解磷菌后,把固定在土壤中的难溶磷释放出来,促进了植物对磷的吸收,进而提高了水稻的生长。今后将测试在胁迫条件下,解磷菌是否仍有解磷能力。

图注:不同字母(a、b)表示各处理组之间存在显著性差异(P < 0.05)。--

Figure 9. Determination of the growth-promoting effects and physiological indicators of mixed bacteria on rice

图9. 混合菌群对水稻促生效果和生理指标的测定

4. 讨论

磷作为三大营养元素之一,是作物生长必不可少的营养元素。在土壤中,磷素大多以难溶性磷酸盐的形态存在,植物难以直接吸收利用。土壤中存在大量微生物,从水稻土中筛选分离出解磷菌,可以促进土壤中磷素的释放,提高植物对磷的吸收,提升作物的产量和质量。本研究从水稻土中筛选分离出三株解磷菌,C3神户肠杆菌(Enterobacter kobei)、P6恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida)、P12铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)。

低温导致土壤水分的温度下降,进而影响微生物活性。在低温条件下,土壤溶液的粘度增加,磷酸盐的溶解度降低,从而减少了可供植物吸收的有效磷。研究发现,与28℃下的生长曲线相比,低温环境下四种菌株均可以生长,但进入对数期的速度变慢。另外,温度下降,明显抑制了铜绿假单胞菌P12进入对数期的时间。在28℃条件下,四种菌株解无机磷的能力都强于解有机磷。在无机磷NBRIP培养基中,低温抑制了神户肠杆菌C3、铜绿假单胞菌P12的解磷能力。但是荧光假单胞菌PF、恶臭假单胞菌P6在低温条件下,解无机磷的能力增强。在植酸钙培养基中,在28℃条件下,恶臭假单胞菌P6和铜绿假单胞菌P12解植酸钙的能力很弱,P6完全没有,P12略微有一点。荧光假单胞菌PF解植酸钙的能力在低温条件下没有被降低。

盐胁迫不仅会影响微生物体内酶的活性,还会使微生物细胞外的渗透压发生变化。而且还会增加土壤中可溶性盐(如NaCl,Na2SO4等)的浓度。这些盐在水中解离,释放出钠离子(Na⁺)和其他离子,增加土壤溶液的离子强度。这种高离子强度环境会影响土壤中磷酸根离子( PO 4 3 )的溶解度,使其容易与钙(Ca2+)、铝(Al3+)或铁(Fe3+)等金属离子结合,形成难溶的磷酸盐沉淀,从而降低土壤中磷的有效性。研究发现,随着盐浓度的升高,四种菌株的生长都受到抑制,进入对数期的时间都延长。其中神户肠杆菌C3在盐浓度为1%、3%、5%、7%时,相比其它三种菌株,较快地进入对数期。在盐浓度为9%的时候,只有神户肠杆菌C3可以生长。因此,神户肠杆菌C3耐盐能力比较强。在无机磷培养基中,随着盐浓度的升高,四种菌株解无机磷的能力都降低。其中,在盐浓度为5%和7%时,相比其他三种菌株,神户肠杆菌C3具有最高的解无机磷能力。在植酸钙培养基中,在盐浓度为5%和7%时,CK的溶磷量分别为260 mg/L、266 mg/L,荧光假单胞菌PF、神户肠杆菌C3与不加菌的CK相比,磷含量降低,推测被溶解的有机磷用于细菌自身生长。

酸碱胁迫不仅会影响微生物的活性,还会影响土壤中磷的化学形态,进而影响磷的有效性。在酸性土壤中,铝、铁与磷的结合会导致磷被固定;在碱性土壤中,钙的过量会形成不溶性钙磷化合物。因此,保持土壤pH在适宜范围内是确保磷有效性的关键。研究发现,神户肠杆菌C3耐酸碱的能力都比较强,在pH = 4的时候,只有神户肠杆菌C3才能生长。在pH = 6、8、9的时候,神户肠杆菌C3进入对数期的时间最快,且在平台期时具有最大的菌含量。在pH = 10的时候,四种菌株都不能生长。在无机磷NBRIP培养基中,当pH = 6时,神户肠杆菌C3的解磷能力最低,铜绿假单胞菌P12的解磷能力最强。在pH = 9时,同样如此。在有机磷植酸钙培养基中,pH = 6、9时,CK的溶磷量分别为303 mg/L、369 mg/L,荧光假单胞菌PF、神户肠杆菌C3与不加菌的CK相比,溶磷含量增加。

研究发现,施加单菌对水稻生长作用不明显,施加混合菌后水稻生长明显变好,地上部和根部干重和全磷含量都增加,推测加解磷菌后,把固定在土壤中的难溶磷释放出来,促进了植物对磷的吸收,提高了水稻的生长。本研究为提高农业生产中磷资源的利用提供理论基础,同时也为微生物菌肥提供优良的菌株资源。

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